แผนกคดียาเสพติด จัดตั้งขึ้นตามประกาศคณะกรรมการบริหารศาลยุติธรรม เรื่อง การจัดตั้งแผนกในศาลอุทธรณ์และศาลอุทธรณ์ภาค ประกาศในราชกิจจานุเบกษา  เมื่อวันที่ 21 กรกฎาคม 2549 อาศัยอำนาจตามความในมาตรา 4 มาตรา 7 และมาตรา 10 แห่งพระธรรมนูญศาลยุติธรรม คณะกรรมการบริหารศาลยุติธรรมออกประกาศให้จัดตั้งแผนกในศาลอุทธรณ์และศาลอุทธรณ์ภาค

ข้อ 4 ให้จัดตั้งแผนกคดียาเสพติดในศาลอุทธรณ์ และมีอำนาจในคดีของศาลอุทธรณ์เกี่ยวกับกฎหมายยาเสพติด รวมทั้งคดีอื่นๆ ที่คล้ายคลึงกันตามที่ประธานศาลอุทธรณ์จะได้กำหนด